В ряде работ показано, что синтез копий вирусной ДНК на РНК осуществляется на самых ранних стадиях взаимодействия РНК-содержащего вируса с клетками буквально через час после заражения вирусом (Dales, Hanafuas, 1972). Детальные исследования внутриклеточного синтеза вирусной ДНК и ее интеграции с клеточной ДНК проведены в культурах ткани, инфицированных вирусами сарком и лейкоза птиц (Baluda, 1974). Синтез провирусной ДНК наблюдали в течение первого часа после инфицирования клеток. Отмечалось многократное увеличение содержания этой ДНК в инфицированных клетках в начальной стадии взаимодействия вируса с клетками. Вновь синтезированную вирусную ДНК определяли гибридизацией с 70S вирусной РНК. Авторы предполагают, что копии ДНК синтезируются как индивидуальные транскрипты 35S субъединиц вирусной РНК. В последующем только часть синтезированной вирусной ДНК ковалентно связывается с высокомолекулярной клеточной ДНК в течение 24 ч. Остальная ДНК растворяется и деградирует в клетке.
Интегрируется примерно 50% вновь синтезированной вирусной ДНК, что объясняется или ограниченным количеством мест для интеграции, или тем, что только часть синтезированной ДНК способна к осуществлению этого процесса. Процесс интеграции вирусной генетической информации с клеточным генетическим материалом еще мало изучен. Вместе с тем, ссылаясь на недавно опубликованные данные (Takano, Hatanaka, 1975), можно видеть реальные подходы в изучении последовательности внутриклеточных процессов, завершающихся интеграцией генома лейкемогенного вируса с клеточным. Из клеток, инфицированных вирусом Раушера, меченным Н3-уридином, выделили и исследовали ядерные и цитоплазматические нуклеиновые кислоты, используя градиентное центрифугирование и седиментационный анализ. Меченая вирусная РНК образует радиоактивные гибридные молекулы РНК - ДНК в первые часы после заражения клеток в культуре ткани. Гибриды с промежуточной плотностью между двунитчатой ДНК и РНК сначала образуются в цитоплазме, а потом транслоцируются в ядро. Обнаруженные в ядре меченые гибриды молекулы РНК - ДНК могут быть посредниками синтеза двунитчатых ДНК-копий вирусного генома, которые интегрируются с ДНК хромосом, По мнению авторов, гибридные молекулы РНК - ДНК могут интегрировать с клеточной ядерной ДНК хозяина непосредственно. Эта гипотеза предполагает, что гибридные молекулы ядерной фракции являются промежуточным звеном интеграционного процесса, т. е. могут быть ковалентными комплексами участков ДНК клеток и вирусных гибридов РНК - ДНК, синтезированных обратной транскриптазой вирионов или клеток. В подкрепление полученных результатов авторы ссылаются на данные других исследователей, которые нашли подобные гибридные молекулы РНК - ДНК в ядерной фракции клеток, инфицированных вирусом птичьего лейкоза и мышиными лейкемогенными вирусами.